主要从事生物信息学领域相关的课题研究，包括：蛋白质和基因功能预测、蛋白质结构预测、蛋白质结晶倾向性预测、蛋白质-配体相互作用预测等。近年来，以第一作者/共同第一作者身份在《PLOS Computational Biology》、《Genomics, Proteomics & Bioinformatics》、《Briefings in Bioinformatics》、《Journal of Chemical Information and Modeling》、《 Intelligent Systems for Molecular Biology》等期刊上发表论文9篇。主持国家自然科学基金（青年科学基金）1项。

英文主页：https://yiheng-zhu.github.io/Yiheng/index.html.