个人简介：

博士毕业于中国科学院南京土壤研究所，师从褚海燕研究员。现为南京农业大学生命科学学院副教授（高层次人才引进）、中国科学院新疆生态与地理研究所客座特聘研究员。荣获博新计划、江苏省卓越博士后计划等头衔，入选中科院百篇优博，主持国自然青年科学基金、江苏省青年基金、博士后面上等项目，参与青藏高原第二次科学考察项目、水圈微生物驱动地球元素循环的机制重大研究计划、中国科学院土壤生物先导专项、中国科学院盐碱酸性土壤产能提升（后备粮仓）先导专项等大型国家级项目。发表SCI论文三十余篇，其中以第一作者或通讯作者（含共同）在PNAS、Nature Food、iMeta、Microbiome、Advanced Science、Science Bulletin、Soil Biology and Biochemistry等高水平杂志发表十八篇。担任PNAS、SBB、SEL、SUM等期刊审稿人，iMeta期刊青年编委（IF 23.7），Frontiers in Microbiology期刊副编辑。开源发布拆解微生物共存网络关系（Qcmi）和识别高阶网络模块（Motifs）的定量方法，Github下载量已达数百次（https://github.com/joshualiuxu）。研究主要以土壤微生物视角理解农业一体健康 （Soil Microbiome for Agricultural One Health）。

欢迎对微生物生态、绿色农业或生物信息学感兴趣的同学加入我们团队，一起探索土壤微生物的奥秘！

工作经历：

(1)  2023-12 至 2026-3, 南京农业大学，生命科学学院，王保战教授团队，钟山青年研究员

(1)  2026-03 至今, 南京农业大学，生命科学学院，王保战教授团队，副教授

(2)  2024-05 至今, 中国科学院新疆生态与地理研究所，田长彦研究员团队，特聘研究员

教育经历：

(1)  2023-12 至 2026-3, 南京农业大学，农业资源与环境流动站，博士后，导师 邹建文教授 王保战教授

(2)  2017-09 至 2023-12, 中国科学院南京土壤研究所，土壤学，博士，导师 褚海燕研究员

(3)  2013-09 至 2017-07, 南京信息工程大学，农业资源与环境，学士，导师 沈李东教授

研究兴趣：

方向一：微生物生态、演化与资源挖掘

微生物群落是土壤生态系统的基石。我们的研究重点是在动态的生态环境中，微生物种群是如何协同聚集成复杂的生态群落的，关注这些不断演化的群落如何在面对环境波动和全球变化时，依然保持其稳定性和功能韧性。在这一生态学基础上，进一步探索如何有效地挖掘和利用这些至关重要的微生物资源。泛第三极地区是我们重点关注的区域，为我们解析极端环境下的微生物生态、演化与资源提供了绝佳的天然实验场。

代表性文章发表于PNAS、Soil Biology and Biochemistry、Fundamental Research、Applied and Environmental Microbiology等：

l Liu, X., Chu, H.*, Godoy O., Fan K., Gao G., Yang T., Ma Y., Delgado-Baquerizo M.*, 2024. Positive associations fuel soil biodiversity and ecological networks worldwide. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 121, e2308769121.

l Liu X., Zhang C., Yang T., Gao G., Shi Y., Chu H.*, 2023. Phylogenetic relatedness enhances the understanding of microbial coexistence networks in alpine wetlands of the Tibetan Plateau. Soil Biology and Biochemistry 185, 109160.

l Liu, X., Delgado-Baquerizo, M., Yang, T., Gao, G.-F., Shi, Y., & Chu, H. (2026). Contrasting patterns for bacteria and archaea in response to salt stress across alpine wetlands of the Tibetan Plateau. Fundamental Research.

l Zhao, S., Liu, X., Banerjee, S., Hartmann, M., Peng, B., Elvers, R., Zhao, Z.-Y., Zhou, N., Liu, J.-J., Wang, B., Tian, C.-Y., Jiang, J., & Lian, T.-X. (2024). Continuous planting of euhalophyte Suaeda salsa enhances microbial diversity and multifunctionality of saline soil. Applied and Environmental Microbiology, 90(4), e02355-23.

方向二：土壤微生物组与农业可持续发展

土壤微生物组是驱动农业可持续发展的核心力量。我们的研究立足于一体健康（One Health）理念，深入探索植物健康与土壤健康之间密不可分的联系。我们系统解析微生物群落在养分循环、能量流动以及病原防控等过程中所扮演的关键角色。我们的最终目标是，将这些深层的机制性认识转化为生态系统尺度的实际应用，在实现作物增产的同时，有效减少农业温室气体排放，助力绿色农业的发展。

代表性文章发表于Nature Food、Microbiome、Science Bulletin、Communications Earth & Environment等：

l Liu, Xu, Baozhan Wang, and Jiandong Jiang*. 2025. Drought-Tolerant Rhizobacteria Boost Crop Resilience. Nature Food, 6, 1000-1001.

l Li, Zhanbiao, Wandi Luo, Huiting Xie, Cuiping Mo, Bixia Qin, Yige Zhao, Xiao Chen, Songbai Zhang, Yaling Zhao, Mengcen Wang, Yu Yang, Jianhe Cai, Baozhan Wang*, Xu Liu*, and Yu Shi*. 2025. Reovirus Infection Results in Rice Rhizosphere Microbial Community Reassembly through Metabolite-Mediated Recruitment and Exclusion. Microbiome 13(1):214.

l Yang, Teng, Xu Liu, Leho Tedersoo, Xiyuan Xu, Guifeng Gao, Kunkun Fan, Luyao Song, Dan Zhao, Yuying Ma, Li Nie, Di Wu, Jingjing Liu, Qiuyan Tan, Ke Dong, Wu Xiong, Xiaofang Du, Liang Cheng, Lei Zhang, Jiabao Zhang, and Haiyan Chu. 2026. Fungal Diversity Drives Soil Health and Agricultural Sustainability in Black Soils. Science Bulletin.

l Ping Gao, Zhe Tao, Yanhan Ji, Sihan Zhou, Junyue Gong, Chaoyu Deng, Shuai Zhao, Yu Shi, Ning Ling, Yunfeng Yang, Jiandong Jiang, Baozhan Wang*, Xu Liu*. 2026 Carbon starvation facilitates low pH-dependent viral lysogeny and auxiliary metabolic potentials in paddy soils. Communications Earth & Environment (accepted)

方向三：生物信息学工具与方法

针对当前微生物组数据的高维与稀疏特性，致力于开发和应用前沿的生物信息学算法来解析复杂的微生物系统。在方法学上，突破传统生态学原理的限制，利用梯度神经网络等深度学习模型解决群落数据中高比例零值（零膨胀模型）的挑战，精准锁定核心功能类群；构建基于深度学习的大数据融合框架，以实现多组学数据的深度联用，并绘制跨越不同分子水平的复杂关系图谱；开发全新的计算模型，用于定量解析从微生物生态共生网络到蛋白质分子水平的多尺度生物互作，为全面理解群落构建提供坚实的数理支撑。

代表性文章发表于iMeta、Advanced Science、科技导报等：

l Liu, X., Shi, Y., Yang, T., Gao, G.-F., Chu, H.*, 2023. QCMI: A method for quantifying putative biotic associations of microbes at the community level. iMeta 2, e92.

l Ji, Yanhan, Xu Liu, Shuai Zhao, Sihan Zhou, Yufan Yang, Ping Zhang, Yu Shi, Wei Qin, Guibing Zhu, Yongguan Zhu, Yanzheng Gao, Jiandong Jiang, and Baozhan Wang. 2025. Unveiling Global Diversity of Patescibacteriota and Functional Interactions with Host Microbes. Advanced Science e09416.

l 柳旭 等. 2022. “贝叶斯推断在土壤微生物生物地理学中的应用.” 科技导报 40(3):112–20.

团队野外作业剪影（青藏高原垭口、日照金山、藏马、新疆巴音布鲁克大草原）：

团队野外作业实况（念青唐古拉山脉、塔吉克帕米尔、新疆天池、塔吉克牧民儿童）：

其他：

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Twitter:

https://twitter.com/Joshua_MCNE 

ResearchGate:

https://www.researchgate.net/profile/Xu-Liu-149 

Web Of Science:

https://webofscience.clarivate.cn/wos/author/record/AAQ-1762-2020 

Google scholar: 

https://scholar.google.com.hk/citations?user=XiVmzeoAAAAJ&hl=zh-CN