（1）环境化学：研究典型化学与生物污染物在土水环境中迁移转化过程及作用原理，关注活性物质对其环境行为的影响及机制。研究污染物化学与生物传感器及新型检测技术。（2）环境生物学：研究生物（植物、动物、微生物）对有毒有机物的响应特征及吸收积累机制，关注污染的基因毒性等毒理效应。（3）污染生态学：研究土水环境中化学与生物污染物的生态学过程，关注污染物与生物大分子互作关系及其分子生态效应。（4）产地环境质量与地力提升：研究耕地土壤环境质量演化过程、障碍土壤改良与地力提升。（5）环境污染控制：以化学和生物降解为主要途径，研发农田和场地土壤污染控制与修复技术、水污染控制技术、农业面源污染控制技术，关注环境新材料（钝化剂、催化剂、氧化剂、菌剂）和新技术研发。（6）农业固废无害化与资源化：研究畜禽粪便中雌激素、抗生素、病原菌等有害物质的迁移转化规律及去除技术，跟踪其资源化农用后的污染风险，关注资源化利用新技术。（7）区域环境问题及对策：研究区域环境中污染物运移、风险及对策，关注相关环境政策、基准、标准等建设。