沈其荣院士土壤有机肥团队。先后主持国家自然基金面上项目，青年基金项目，中国博士后创新人才支持计划，江苏省青年基金，国家自然基金区域创新发展联合基金课题，国家重点研发子课题，农业农村部重大项目子课题等项目。在Nature Plants（2）,iMeta（5），Nature Communications（2）, ISME J，Advanced Science，Microbiome， Protein&Cell，New Phytologist，Fundamental Research等期刊上发表了十余篇论文，其中高倍引论13篇。开发了ggClusterNet、EasySigR、EasyMultiOmics等R包，Easyamplicon、Easymetagenome、EasyMetaPro等组学分析流程。iMeta期刊青年编委，土壤学会土壤生物和化学专业委员会青年委员。获大北农科技奖青年科技创新奖，博士后业绩评估I档资助等奖励。当前H指数为28，总引用量超过4000次。

本人主要从事植物—土壤微生物互作方向研究，重点关注根系分泌物介导的土壤微生物群落与植物互作过程、土壤微生物群落群体波动及其功能涌现机制，以及微生物组学联合多组学技术方法的开发及其在土壤菌群研究中的应用。同时，以全球农田为对象，开展土壤微生物群落空间格局的系统解析，以及大尺度视角下农田作物适应性功能涌现性的研究。